对于应扣未扣个人所得税的情形，向纳税人追缴税款，对扣缴义务人处罚以50%到3倍的罚款，对扣缴义务人不加收滞纳金等规定，实务中基本上没争议，但对纳税人应不应该加收滞纳金还是有争议。

在我看来，对纳税人不应加收滞纳金，文件规定得很明确：

三、关于应扣未扣税款是否加收滞纳金的问题　

按照《征管法》规定的原则，扣缴义务人应扣未扣税款，无论适用修订前还是修订后的《征管法》，均不得向纳税人或扣缴义务人加收滞纳金。

这个文件应该是说得很清楚了：无论按新征管法还是旧征管法，也无论对纳税人还是扣缴义务人，都不得加收滞纳金。

但有人却不这么认为，他们有各种各样的理由：

1、国税函文件效力低于征管法，无效。

2、1199号文是个案批复文件，不具有普遍适用性。

3、1199号文说的是行政机关，其他纳税人不能适用。

4、扣缴义务人未代扣代缴，纳税人有自行申报缴纳的义务，未按时申报缴纳，从滞纳税款之日起应该加收滞纳金。

我觉得这些理由都不成其为理由：

1、国税函文件与征管法效力问题。法律文件效力有层级性是不错，但下级文件与上级文件内容上没有冲突的话，不存在较低级别文件无效。在应扣未扣个税是否加收滞纳金方面，征管法并没有要加收滞纳金的意思表述，如果有，1199号文违背了征管法规定无效，但征管法没有说。

2、个案批复不具有普遍适用性问题，这个问题在很多业务问题讨论时都存在。我对持这种观点的人简直无话可说，个案批复同类问题都不能适用，意思就是说同类问题一个一个都要去请示，总局一个一个都要发个文件，这岂不荒唐？1199号文是对广西的答复，那么其他省对这个问题也要去请示一下，总局也要给个文件答复？

3、1199号文说的是行政机关，其他纳税人不能适用。

1199号文全文是这样的：

《国家税务总局关于行政机关应扣未扣个人所得税问题的批复》国税函[2004]1199号

你局《关于行政机关应扣未扣个人所得税法律责任问题的请示》（桂地税报[2004]45号）收悉，经研究，现批复如下：　

一、关于个人所得税扣缴义务人的认定问题　

根据《中华人民共和国个人所得税法》（以下简称《个人所得税法》）第八条规定，行政机关是个人所得税的扣缴义务人，其向职工支付工资、奖金、补贴及其他工资薪金性质的收入，应依法代扣代缴个人所得税。　

二、关于扣缴义务人应扣未扣税款的法律责任问题　

2001年5月1日前，对扣缴义务人应扣未扣税款，适用修订前的《中华人民共和国税收征收管理法》（以下简称《征管法》），由扣缴义务人缴纳应扣未扣税款；2001年5月1日后，对扣缴义务人应扣未扣税款，适用修订后的《征管法》和《国家税务总局关于贯彻〈中华人民共和国税收征收管理法〉及其实施细则若干具体问题的通知》（国税发[2003]47号），由税务机关责成扣缴义务人向纳税人追缴税款，对扣缴义务人处应扣未扣税款百分之五十以上三倍以下的罚款。　

三、关于应扣未扣税款是否加收滞纳金的问题　

按照《征管法》规定的原则，扣缴义务人应扣未扣税款，无论适用修订前还是修订后的《征管法》，均不得向纳税人或扣缴义务人加收滞纳金。

1199号文标题虽然是关于行政机关应扣未扣个人所得税问题的批复，但文件内容通篇都是引用个人所得税法、征管法的原文，文件中在在处处都是讲的纳税人扣缴义务人，而没有局限于行政机关。所以，我们不能过于纠结于标题而忽视内容。

另一方面，本来可以普遍适用的文件只对某一类纳税人适用，这在适用主体上有歧视。

4、扣缴义务人未代扣代缴，纳税人有自行申报缴纳的义务，未按时申报缴纳，从滞纳税款之日起应该加收滞纳金。这观点从根本上否定了1199号文，无须辨驳。

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